Замість 24 терорганів Пенітенціарної служби створено 6 міжрегіональних управлінь
Кабмін постановою від 18 травня 2016 року № 348 ліквідував 24 територіальні органи управління Державної пенітенціарної служби.
Одночасно створено 6 міжрегіональних управлінь з питань виконання кримінальних покарань і пробації Міністерства юстиції: Західне (Львів), Південне (Одеса), Південно-Східне (Дніпропетровськ), Північно-Східне (Харків), Центральне (Київ) і Центрально-Західне (Вінниця) .
Ці міжрегіональні управління є правонаступниками територіальних органів управління Пенітенціарної служби.
У Кабміні вважають, що таке рішення дозволить оптимізувати структуру кримінально-виконавчої системи, спростити управління підрозділами і зробити систему більш гнучкою, оперативною, дієвою, впровадити нові підходи до заохочення персоналу та впровадити ефективне управління підприємствами установ виконання покарань. Крім того, прийняття акта сприятиме реалізації заходів, спрямованих на поліпшення умов відбування покарань та утримання під вартою засуджених і осіб, узятих під варту та раціонального використання бюджетних коштів.